Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF18Q9Y5U5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF18Q9Y5U5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18Q9Y5U5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18Q9Y5U5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18Q9Y5U5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18Q9Y5U5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18Q9Y5U5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18Q9Y5U5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF18Q9Y5U5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF18Q9Y5U5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF18Q9Y5U5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF18Q9Y5U5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF18Q9Y5U5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF18Q9Y5U5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF18Q9Y5U5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF18Q9Y5U5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF18Q9Y5U5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF18Q9Y5U5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF18Q9Y5U5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF18Q9Y5U5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF18Q9Y5U5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF18Q9Y5U5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF18Q9Y5U5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF18Q9Y5U5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF18Q9Y5U5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF18Q9Y5U5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF18Q9Y5U5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF18Q9Y5U5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF18Q9Y5U5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF18Q9Y5U5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF18Q9Y5U5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF18Q9Y5U5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF18Q9Y5U5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF18Q9Y5U5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF18Q9Y5U5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms