Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V0

C15orf41, Uncharacterized protein C15orf41, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41Q9Y2V0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C15orf41Q9Y2V0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C15orf41Q9Y2V0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C15orf41Q9Y2V0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C15orf41Q9Y2V0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C15orf41Q9Y2V0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C15orf41Q9Y2V0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C15orf41Q9Y2V0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C15orf41Q9Y2V0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C15orf41Q9Y2V0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C15orf41Q9Y2V0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C15orf41Q9Y2V0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C15orf41Q9Y2V0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C15orf41Q9Y2V0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C15orf41Q9Y2V0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C15orf41Q9Y2V0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C15orf41Q9Y2V0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C15orf41Q9Y2V0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C15orf41Q9Y2V0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C15orf41Q9Y2V0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C15orf41Q9Y2V0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C15orf41Q9Y2V0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C15orf41Q9Y2V0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C15orf41Q9Y2V0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C15orf41Q9Y2V0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C15orf41Q9Y2V0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C15orf41Q9Y2V0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C15orf41Q9Y2V0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C15orf41Q9Y2V0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C15orf41Q9Y2V0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C15orf41Q9Y2V0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C15orf41Q9Y2V0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C15orf41Q9Y2V0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C15orf41Q9Y2V0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C15orf41Q9Y2V0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C15orf41Q9Y2V0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C15orf41Q9Y2V0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C15orf41Q9Y2V0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C15orf41Q9Y2V0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C15orf41Q9Y2V0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
C15orf41Q9Y2V0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C15orf41Q9Y2V0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C15orf41Q9Y2V0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C15orf41Q9Y2V0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C15orf41Q9Y2V0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C15orf41Q9Y2V0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C15orf41Q9Y2V0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C15orf41Q9Y2V0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C15orf41Q9Y2V0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C15orf41Q9Y2V0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C15orf41Q9Y2V0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C15orf41Q9Y2V0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C15orf41Q9Y2V0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C15orf41Q9Y2V0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C15orf41Q9Y2V0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf41Q9Y2V0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C15orf41Q9Y2V0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C15orf41Q9Y2V0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C15orf41Q9Y2V0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C15orf41Q9Y2V0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C15orf41Q9Y2V0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C15orf41Q9Y2V0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C15orf41Q9Y2V0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C15orf41Q9Y2V0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C15orf41Q9Y2V0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C15orf41Q9Y2V0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms