Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y261

FOXA2, Hepatocyte nuclear factor 3-beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA2Q9Y261 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXA2Q9Y261 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXA2Q9Y261 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXA2Q9Y261 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXA2Q9Y261 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXA2Q9Y261 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXA2Q9Y261 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXA2Q9Y261 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXA2Q9Y261 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXA2Q9Y261 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXA2Q9Y261 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXA2Q9Y261 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXA2Q9Y261 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXA2Q9Y261 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXA2Q9Y261 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXA2Q9Y261 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXA2Q9Y261 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXA2Q9Y261 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXA2Q9Y261 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXA2Q9Y261 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXA2Q9Y261 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXA2Q9Y261 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXA2Q9Y261 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXA2Q9Y261 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXA2Q9Y261 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXA2Q9Y261 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXA2Q9Y261 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXA2Q9Y261 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXA2Q9Y261 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXA2Q9Y261 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXA2Q9Y261 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXA2Q9Y261 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXA2Q9Y261 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms