Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTNND2Q9UQB3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTNND2Q9UQB3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTNND2Q9UQB3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CTNND2Q9UQB3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTNND2Q9UQB3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTNND2Q9UQB3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CTNND2Q9UQB3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CTNND2Q9UQB3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CTNND2Q9UQB3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CTNND2Q9UQB3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CTNND2Q9UQB3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CTNND2Q9UQB3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CTNND2Q9UQB3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CTNND2Q9UQB3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CTNND2Q9UQB3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CTNND2Q9UQB3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CTNND2Q9UQB3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CTNND2Q9UQB3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CTNND2Q9UQB3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CTNND2Q9UQB3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CTNND2Q9UQB3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTNND2Q9UQB3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTNND2Q9UQB3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTNND2Q9UQB3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CTNND2Q9UQB3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CTNND2Q9UQB3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CTNND2Q9UQB3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CTNND2Q9UQB3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CTNND2Q9UQB3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CTNND2Q9UQB3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CTNND2Q9UQB3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CTNND2Q9UQB3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CTNND2Q9UQB3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CTNND2Q9UQB3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CTNND2Q9UQB3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CTNND2Q9UQB3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CTNND2Q9UQB3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CTNND2Q9UQB3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CTNND2Q9UQB3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CTNND2Q9UQB3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CTNND2Q9UQB3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTNND2Q9UQB3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CTNND2Q9UQB3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CTNND2Q9UQB3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CTNND2Q9UQB3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CTNND2Q9UQB3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CTNND2Q9UQB3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CTNND2Q9UQB3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CTNND2Q9UQB3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CTNND2Q9UQB3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CTNND2Q9UQB3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CTNND2Q9UQB3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNND2Q9UQB3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CTNND2Q9UQB3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CTNND2Q9UQB3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CTNND2Q9UQB3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CTNND2Q9UQB3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CTNND2Q9UQB3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CTNND2Q9UQB3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CTNND2Q9UQB3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CTNND2Q9UQB3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CTNND2Q9UQB3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CTNND2Q9UQB3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CTNND2Q9UQB3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CTNND2Q9UQB3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms