Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX6Q9UNH7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX6Q9UNH7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX6Q9UNH7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX6Q9UNH7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX6Q9UNH7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX6Q9UNH7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX6Q9UNH7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX6Q9UNH7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX6Q9UNH7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX6Q9UNH7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX6Q9UNH7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX6Q9UNH7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX6Q9UNH7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX6Q9UNH7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX6Q9UNH7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX6Q9UNH7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX6Q9UNH7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX6Q9UNH7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX6Q9UNH7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX6Q9UNH7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX6Q9UNH7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX6Q9UNH7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX6Q9UNH7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX6Q9UNH7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX6Q9UNH7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX6Q9UNH7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX6Q9UNH7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX6Q9UNH7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX6Q9UNH7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX6Q9UNH7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX6Q9UNH7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX6Q9UNH7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX6Q9UNH7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX6Q9UNH7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX6Q9UNH7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX6Q9UNH7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX6Q9UNH7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX6Q9UNH7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX6Q9UNH7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX6Q9UNH7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX6Q9UNH7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX6Q9UNH7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX6Q9UNH7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX6Q9UNH7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX6Q9UNH7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX6Q9UNH7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX6Q9UNH7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX6Q9UNH7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX6Q9UNH7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms