Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEMTQ9UBM1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEMTQ9UBM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEMTQ9UBM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEMTQ9UBM1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEMTQ9UBM1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEMTQ9UBM1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEMTQ9UBM1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEMTQ9UBM1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEMTQ9UBM1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEMTQ9UBM1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PEMTQ9UBM1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEMTQ9UBM1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEMTQ9UBM1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEMTQ9UBM1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEMTQ9UBM1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEMTQ9UBM1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEMTQ9UBM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEMTQ9UBM1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEMTQ9UBM1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEMTQ9UBM1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEMTQ9UBM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEMTQ9UBM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEMTQ9UBM1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEMTQ9UBM1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEMTQ9UBM1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEMTQ9UBM1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEMTQ9UBM1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEMTQ9UBM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PEMTQ9UBM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEMTQ9UBM1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEMTQ9UBM1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEMTQ9UBM1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEMTQ9UBM1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEMTQ9UBM1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEMTQ9UBM1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEMTQ9UBM1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEMTQ9UBM1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PEMTQ9UBM1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PEMTQ9UBM1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PEMTQ9UBM1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEMTQ9UBM1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEMTQ9UBM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PEMTQ9UBM1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms