Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD2Q9UBB5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD2Q9UBB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD2Q9UBB5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD2Q9UBB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD2Q9UBB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD2Q9UBB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD2Q9UBB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD2Q9UBB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD2Q9UBB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD2Q9UBB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD2Q9UBB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD2Q9UBB5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD2Q9UBB5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD2Q9UBB5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD2Q9UBB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD2Q9UBB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD2Q9UBB5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD2Q9UBB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD2Q9UBB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD2Q9UBB5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD2Q9UBB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD2Q9UBB5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD2Q9UBB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD2Q9UBB5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD2Q9UBB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MBD2Q9UBB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MBD2Q9UBB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MBD2Q9UBB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD2Q9UBB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD2Q9UBB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD2Q9UBB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MBD2Q9UBB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD2Q9UBB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD2Q9UBB5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD2Q9UBB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD2Q9UBB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD2Q9UBB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD2Q9UBB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD2Q9UBB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD2Q9UBB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD2Q9UBB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD2Q9UBB5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD2Q9UBB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD2Q9UBB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD2Q9UBB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD2Q9UBB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD2Q9UBB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD2Q9UBB5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD2Q9UBB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD2Q9UBB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD2Q9UBB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD2Q9UBB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD2Q9UBB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD2Q9UBB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms