Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL39Q9NYK5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL39Q9NYK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL39Q9NYK5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL39Q9NYK5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL39Q9NYK5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL39Q9NYK5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL39Q9NYK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL39Q9NYK5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL39Q9NYK5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL39Q9NYK5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL39Q9NYK5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL39Q9NYK5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL39Q9NYK5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL39Q9NYK5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPL39Q9NYK5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL39Q9NYK5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL39Q9NYK5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL39Q9NYK5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL39Q9NYK5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL39Q9NYK5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL39Q9NYK5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL39Q9NYK5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL39Q9NYK5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL39Q9NYK5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL39Q9NYK5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL39Q9NYK5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL39Q9NYK5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL39Q9NYK5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL39Q9NYK5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL39Q9NYK5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MRPL39Q9NYK5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL39Q9NYK5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL39Q9NYK5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL39Q9NYK5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL39Q9NYK5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL39Q9NYK5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL39Q9NYK5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL39Q9NYK5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL39Q9NYK5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL39Q9NYK5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL39Q9NYK5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL39Q9NYK5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL39Q9NYK5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL39Q9NYK5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL39Q9NYK5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL39Q9NYK5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL39Q9NYK5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.8 ms