Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN3BQ9NY72 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN3BQ9NY72 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN3BQ9NY72 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN3BQ9NY72 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN3BQ9NY72 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN3BQ9NY72 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN3BQ9NY72 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN3BQ9NY72 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN3BQ9NY72 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN3BQ9NY72 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN3BQ9NY72 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN3BQ9NY72 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN3BQ9NY72 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN3BQ9NY72 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN3BQ9NY72 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN3BQ9NY72 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN3BQ9NY72 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN3BQ9NY72 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN3BQ9NY72 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN3BQ9NY72 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN3BQ9NY72 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN3BQ9NY72 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN3BQ9NY72 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN3BQ9NY72 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN3BQ9NY72 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN3BQ9NY72 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN3BQ9NY72 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN3BQ9NY72 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN3BQ9NY72 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN3BQ9NY72 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN3BQ9NY72 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN3BQ9NY72 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCN3BQ9NY72 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN3BQ9NY72 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN3BQ9NY72 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN3BQ9NY72 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN3BQ9NY72 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN3BQ9NY72 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN3BQ9NY72 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN3BQ9NY72 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN3BQ9NY72 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN3BQ9NY72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN3BQ9NY72 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN3BQ9NY72 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN3BQ9NY72 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN3BQ9NY72 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN3BQ9NY72 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN3BQ9NY72 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN3BQ9NY72 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN3BQ9NY72 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN3BQ9NY72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN3BQ9NY72 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN3BQ9NY72 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms