Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN3BQ9NY72 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN3BQ9NY72 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN3BQ9NY72 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCN3BQ9NY72 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN3BQ9NY72 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN3BQ9NY72 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN3BQ9NY72 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN3BQ9NY72 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN3BQ9NY72 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN3BQ9NY72 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN3BQ9NY72 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN3BQ9NY72 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN3BQ9NY72 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN3BQ9NY72 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN3BQ9NY72 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN3BQ9NY72 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN3BQ9NY72 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN3BQ9NY72 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN3BQ9NY72 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN3BQ9NY72 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN3BQ9NY72 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN3BQ9NY72 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN3BQ9NY72 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN3BQ9NY72 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN3BQ9NY72 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN3BQ9NY72 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN3BQ9NY72 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN3BQ9NY72 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN3BQ9NY72 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN3BQ9NY72 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN3BQ9NY72 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN3BQ9NY72 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN3BQ9NY72 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN3BQ9NY72 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN3BQ9NY72 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN3BQ9NY72 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN3BQ9NY72 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN3BQ9NY72 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN3BQ9NY72 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN3BQ9NY72 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN3BQ9NY72 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN3BQ9NY72 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN3BQ9NY72 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN3BQ9NY72 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN3BQ9NY72 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN3BQ9NY72 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN3BQ9NY72 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN3BQ9NY72 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN3BQ9NY72 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN3BQ9NY72 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN3BQ9NY72 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN3BQ9NY72 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN3BQ9NY72 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN3BQ9NY72 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN3BQ9NY72 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN3BQ9NY72 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN3BQ9NY72 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN3BQ9NY72 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN3BQ9NY72 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN3BQ9NY72 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN3BQ9NY72 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN3BQ9NY72 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN3BQ9NY72 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN3BQ9NY72 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN3BQ9NY72 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN3BQ9NY72 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN3BQ9NY72 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN3BQ9NY72 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN3BQ9NY72 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN3BQ9NY72 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN3BQ9NY72 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN3BQ9NY72 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN3BQ9NY72 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN3BQ9NY72 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN3BQ9NY72 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN3BQ9NY72 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN3BQ9NY72 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN3BQ9NY72 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN3BQ9NY72 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN3BQ9NY72 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN3BQ9NY72 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN3BQ9NY72 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN3BQ9NY72 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN3BQ9NY72 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN3BQ9NY72 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN3BQ9NY72 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN3BQ9NY72 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN3BQ9NY72 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN3BQ9NY72 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN3BQ9NY72 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN3BQ9NY72 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms