Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AP5S1Q9NUS5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP5S1Q9NUS5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP5S1Q9NUS5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP5S1Q9NUS5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP5S1Q9NUS5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP5S1Q9NUS5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP5S1Q9NUS5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP5S1Q9NUS5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP5S1Q9NUS5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP5S1Q9NUS5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP5S1Q9NUS5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP5S1Q9NUS5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP5S1Q9NUS5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP5S1Q9NUS5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP5S1Q9NUS5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AP5S1Q9NUS5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP5S1Q9NUS5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP5S1Q9NUS5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP5S1Q9NUS5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP5S1Q9NUS5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP5S1Q9NUS5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP5S1Q9NUS5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP5S1Q9NUS5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP5S1Q9NUS5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP5S1Q9NUS5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP5S1Q9NUS5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP5S1Q9NUS5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP5S1Q9NUS5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP5S1Q9NUS5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AP5S1Q9NUS5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP5S1Q9NUS5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP5S1Q9NUS5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP5S1Q9NUS5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP5S1Q9NUS5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP5S1Q9NUS5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms