Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP5S1Q9NUS5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP5S1Q9NUS5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP5S1Q9NUS5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP5S1Q9NUS5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP5S1Q9NUS5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP5S1Q9NUS5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP5S1Q9NUS5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5S1Q9NUS5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5S1Q9NUS5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5S1Q9NUS5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP5S1Q9NUS5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP5S1Q9NUS5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5S1Q9NUS5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP5S1Q9NUS5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5S1Q9NUS5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5S1Q9NUS5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5S1Q9NUS5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP5S1Q9NUS5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AP5S1Q9NUS5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5S1Q9NUS5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5S1Q9NUS5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP5S1Q9NUS5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP5S1Q9NUS5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5S1Q9NUS5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP5S1Q9NUS5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5S1Q9NUS5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5S1Q9NUS5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5S1Q9NUS5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5S1Q9NUS5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5S1Q9NUS5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5S1Q9NUS5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5S1Q9NUS5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP5S1Q9NUS5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP5S1Q9NUS5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5S1Q9NUS5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5S1Q9NUS5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP5S1Q9NUS5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5S1Q9NUS5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5S1Q9NUS5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5S1Q9NUS5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5S1Q9NUS5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5S1Q9NUS5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5S1Q9NUS5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5S1Q9NUS5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5S1Q9NUS5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5S1Q9NUS5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP5S1Q9NUS5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP5S1Q9NUS5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP5S1Q9NUS5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP5S1Q9NUS5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP5S1Q9NUS5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5S1Q9NUS5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5S1Q9NUS5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5S1Q9NUS5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5S1Q9NUS5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5S1Q9NUS5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5S1Q9NUS5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP5S1Q9NUS5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP5S1Q9NUS5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP5S1Q9NUS5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP5S1Q9NUS5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP5S1Q9NUS5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP5S1Q9NUS5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP5S1Q9NUS5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP5S1Q9NUS5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP5S1Q9NUS5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP5S1Q9NUS5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP5S1Q9NUS5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP5S1Q9NUS5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP5S1Q9NUS5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP5S1Q9NUS5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP5S1Q9NUS5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP5S1Q9NUS5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP5S1Q9NUS5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP5S1Q9NUS5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP5S1Q9NUS5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP5S1Q9NUS5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP5S1Q9NUS5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP5S1Q9NUS5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP5S1Q9NUS5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP5S1Q9NUS5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP5S1Q9NUS5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP5S1Q9NUS5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP5S1Q9NUS5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP5S1Q9NUS5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5S1Q9NUS5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5S1Q9NUS5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5S1Q9NUS5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5S1Q9NUS5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5S1Q9NUS5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5S1Q9NUS5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms