Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLE3Q9NRF9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLE3Q9NRF9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLE3Q9NRF9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLE3Q9NRF9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLE3Q9NRF9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLE3Q9NRF9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLE3Q9NRF9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLE3Q9NRF9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLE3Q9NRF9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLE3Q9NRF9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLE3Q9NRF9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLE3Q9NRF9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLE3Q9NRF9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLE3Q9NRF9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLE3Q9NRF9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLE3Q9NRF9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLE3Q9NRF9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLE3Q9NRF9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLE3Q9NRF9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLE3Q9NRF9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLE3Q9NRF9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLE3Q9NRF9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLE3Q9NRF9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLE3Q9NRF9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLE3Q9NRF9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLE3Q9NRF9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLE3Q9NRF9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLE3Q9NRF9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLE3Q9NRF9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLE3Q9NRF9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLE3Q9NRF9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLE3Q9NRF9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLE3Q9NRF9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLE3Q9NRF9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLE3Q9NRF9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLE3Q9NRF9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLE3Q9NRF9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLE3Q9NRF9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLE3Q9NRF9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLE3Q9NRF9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLE3Q9NRF9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLE3Q9NRF9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLE3Q9NRF9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLE3Q9NRF9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLE3Q9NRF9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms