Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFDN4Q9NQP4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFDN4Q9NQP4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFDN4Q9NQP4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PFDN4Q9NQP4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFDN4Q9NQP4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFDN4Q9NQP4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFDN4Q9NQP4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PFDN4Q9NQP4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFDN4Q9NQP4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PFDN4Q9NQP4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFDN4Q9NQP4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFDN4Q9NQP4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFDN4Q9NQP4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PFDN4Q9NQP4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PFDN4Q9NQP4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFDN4Q9NQP4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFDN4Q9NQP4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFDN4Q9NQP4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFDN4Q9NQP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFDN4Q9NQP4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFDN4Q9NQP4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFDN4Q9NQP4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFDN4Q9NQP4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFDN4Q9NQP4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFDN4Q9NQP4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFDN4Q9NQP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFDN4Q9NQP4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFDN4Q9NQP4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFDN4Q9NQP4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFDN4Q9NQP4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFDN4Q9NQP4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFDN4Q9NQP4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFDN4Q9NQP4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFDN4Q9NQP4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFDN4Q9NQP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFDN4Q9NQP4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFDN4Q9NQP4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFDN4Q9NQP4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PFDN4Q9NQP4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFDN4Q9NQP4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PFDN4Q9NQP4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFDN4Q9NQP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFDN4Q9NQP4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFDN4Q9NQP4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFDN4Q9NQP4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFDN4Q9NQP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFDN4Q9NQP4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFDN4Q9NQP4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PFDN4Q9NQP4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PFDN4Q9NQP4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PFDN4Q9NQP4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PFDN4Q9NQP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFDN4Q9NQP4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFDN4Q9NQP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFDN4Q9NQP4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFDN4Q9NQP4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFDN4Q9NQP4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFDN4Q9NQP4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFDN4Q9NQP4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFDN4Q9NQP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFDN4Q9NQP4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms