Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CD248Q9HCU0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CD248Q9HCU0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CD248Q9HCU0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CD248Q9HCU0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CD248Q9HCU0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CD248Q9HCU0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD248Q9HCU0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD248Q9HCU0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD248Q9HCU0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD248Q9HCU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD248Q9HCU0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD248Q9HCU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD248Q9HCU0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD248Q9HCU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD248Q9HCU0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CD248Q9HCU0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD248Q9HCU0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD248Q9HCU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD248Q9HCU0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD248Q9HCU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD248Q9HCU0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD248Q9HCU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD248Q9HCU0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD248Q9HCU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD248Q9HCU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD248Q9HCU0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD248Q9HCU0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CD248Q9HCU0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD248Q9HCU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD248Q9HCU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD248Q9HCU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD248Q9HCU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD248Q9HCU0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD248Q9HCU0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD248Q9HCU0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD248Q9HCU0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD248Q9HCU0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD248Q9HCU0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CD248Q9HCU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD248Q9HCU0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD248Q9HCU0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD248Q9HCU0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD248Q9HCU0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD248Q9HCU0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD248Q9HCU0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD248Q9HCU0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD248Q9HCU0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD248Q9HCU0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD248Q9HCU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD248Q9HCU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD248Q9HCU0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD248Q9HCU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD248Q9HCU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD248Q9HCU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD248Q9HCU0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD248Q9HCU0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD248Q9HCU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD248Q9HCU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD248Q9HCU0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CD248Q9HCU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD248Q9HCU0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD248Q9HCU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD248Q9HCU0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD248Q9HCU0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD248Q9HCU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD248Q9HCU0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CD248Q9HCU0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD248Q9HCU0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD248Q9HCU0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD248Q9HCU0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms