Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD5Q9GZQ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD5Q9GZQ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD5Q9GZQ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD5Q9GZQ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD5Q9GZQ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD5Q9GZQ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD5Q9GZQ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD5Q9GZQ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD5Q9GZQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD5Q9GZQ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD5Q9GZQ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD5Q9GZQ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD5Q9GZQ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD5Q9GZQ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD5Q9GZQ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD5Q9GZQ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD5Q9GZQ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD5Q9GZQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD5Q9GZQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD5Q9GZQ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD5Q9GZQ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD5Q9GZQ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD5Q9GZQ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD5Q9GZQ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD5Q9GZQ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD5Q9GZQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD5Q9GZQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD5Q9GZQ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD5Q9GZQ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD5Q9GZQ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD5Q9GZQ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD5Q9GZQ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD5Q9GZQ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD5Q9GZQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD5Q9GZQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD5Q9GZQ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD5Q9GZQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD5Q9GZQ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD5Q9GZQ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COMMD5Q9GZQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COMMD5Q9GZQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COMMD5Q9GZQ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMMD5Q9GZQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD5Q9GZQ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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