Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTPBP4Q9BZE4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTPBP4Q9BZE4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTPBP4Q9BZE4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTPBP4Q9BZE4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTPBP4Q9BZE4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTPBP4Q9BZE4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTPBP4Q9BZE4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GTPBP4Q9BZE4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GTPBP4Q9BZE4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTPBP4Q9BZE4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GTPBP4Q9BZE4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTPBP4Q9BZE4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTPBP4Q9BZE4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTPBP4Q9BZE4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GTPBP4Q9BZE4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GTPBP4Q9BZE4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTPBP4Q9BZE4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTPBP4Q9BZE4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTPBP4Q9BZE4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTPBP4Q9BZE4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTPBP4Q9BZE4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTPBP4Q9BZE4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTPBP4Q9BZE4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTPBP4Q9BZE4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTPBP4Q9BZE4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTPBP4Q9BZE4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTPBP4Q9BZE4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTPBP4Q9BZE4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTPBP4Q9BZE4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTPBP4Q9BZE4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GTPBP4Q9BZE4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTPBP4Q9BZE4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTPBP4Q9BZE4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTPBP4Q9BZE4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTPBP4Q9BZE4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTPBP4Q9BZE4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTPBP4Q9BZE4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTPBP4Q9BZE4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTPBP4Q9BZE4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTPBP4Q9BZE4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTPBP4Q9BZE4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
GTPBP4Q9BZE4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTPBP4Q9BZE4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
GTPBP4Q9BZE4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTPBP4Q9BZE4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTPBP4Q9BZE4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GTPBP4Q9BZE4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GTPBP4Q9BZE4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTPBP4Q9BZE4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTPBP4Q9BZE4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTPBP4Q9BZE4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTPBP4Q9BZE4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTPBP4Q9BZE4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GTPBP4Q9BZE4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTPBP4Q9BZE4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTPBP4Q9BZE4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTPBP4Q9BZE4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTPBP4Q9BZE4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTPBP4Q9BZE4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTPBP4Q9BZE4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTPBP4Q9BZE4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTPBP4Q9BZE4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTPBP4Q9BZE4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GTPBP4Q9BZE4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTPBP4Q9BZE4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GTPBP4Q9BZE4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GTPBP4Q9BZE4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GTPBP4Q9BZE4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GTPBP4Q9BZE4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTPBP4Q9BZE4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTPBP4Q9BZE4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GTPBP4Q9BZE4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GTPBP4Q9BZE4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms