Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPGQ9BPX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPGQ9BPX3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPGQ9BPX3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPGQ9BPX3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPGQ9BPX3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCAPGQ9BPX3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NCAPGQ9BPX3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCAPGQ9BPX3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCAPGQ9BPX3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCAPGQ9BPX3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPGQ9BPX3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCAPGQ9BPX3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPGQ9BPX3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPGQ9BPX3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPGQ9BPX3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NCAPGQ9BPX3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPGQ9BPX3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCAPGQ9BPX3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPGQ9BPX3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPGQ9BPX3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPGQ9BPX3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPGQ9BPX3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPGQ9BPX3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPGQ9BPX3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPGQ9BPX3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPGQ9BPX3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPGQ9BPX3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPGQ9BPX3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPGQ9BPX3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPGQ9BPX3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPGQ9BPX3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPGQ9BPX3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPGQ9BPX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPGQ9BPX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPGQ9BPX3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPGQ9BPX3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPGQ9BPX3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPGQ9BPX3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCAPGQ9BPX3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCAPGQ9BPX3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCAPGQ9BPX3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPGQ9BPX3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPGQ9BPX3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCAPGQ9BPX3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCAPGQ9BPX3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCAPGQ9BPX3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCAPGQ9BPX3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCAPGQ9BPX3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCAPGQ9BPX3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPGQ9BPX3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPGQ9BPX3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms