Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RMDN2Q96LZ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RMDN2Q96LZ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RMDN2Q96LZ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RMDN2Q96LZ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RMDN2Q96LZ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RMDN2Q96LZ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RMDN2Q96LZ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RMDN2Q96LZ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RMDN2Q96LZ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RMDN2Q96LZ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RMDN2Q96LZ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RMDN2Q96LZ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RMDN2Q96LZ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RMDN2Q96LZ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RMDN2Q96LZ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RMDN2Q96LZ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RMDN2Q96LZ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RMDN2Q96LZ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RMDN2Q96LZ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RMDN2Q96LZ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RMDN2Q96LZ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RMDN2Q96LZ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RMDN2Q96LZ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RMDN2Q96LZ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RMDN2Q96LZ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RMDN2Q96LZ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RMDN2Q96LZ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RMDN2Q96LZ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN2Q96LZ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN2Q96LZ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RMDN2Q96LZ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RMDN2Q96LZ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RMDN2Q96LZ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RMDN2Q96LZ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RMDN2Q96LZ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN2Q96LZ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RMDN2Q96LZ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RMDN2Q96LZ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RMDN2Q96LZ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RMDN2Q96LZ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN2Q96LZ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN2Q96LZ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RMDN2Q96LZ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RMDN2Q96LZ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN2Q96LZ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN2Q96LZ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN2Q96LZ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RMDN2Q96LZ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RMDN2Q96LZ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN2Q96LZ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN2Q96LZ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN2Q96LZ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RMDN2Q96LZ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN2Q96LZ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RMDN2Q96LZ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RMDN2Q96LZ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RMDN2Q96LZ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RMDN2Q96LZ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN2Q96LZ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN2Q96LZ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RMDN2Q96LZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RMDN2Q96LZ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RMDN2Q96LZ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RMDN2Q96LZ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RMDN2Q96LZ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RMDN2Q96LZ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RMDN2Q96LZ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms