Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDL1Q96EA4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDL1Q96EA4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDL1Q96EA4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDL1Q96EA4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDL1Q96EA4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDL1Q96EA4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDL1Q96EA4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPDL1Q96EA4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPDL1Q96EA4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDL1Q96EA4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPDL1Q96EA4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDL1Q96EA4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDL1Q96EA4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDL1Q96EA4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDL1Q96EA4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPDL1Q96EA4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPDL1Q96EA4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDL1Q96EA4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDL1Q96EA4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDL1Q96EA4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDL1Q96EA4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDL1Q96EA4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDL1Q96EA4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDL1Q96EA4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDL1Q96EA4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPDL1Q96EA4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDL1Q96EA4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPDL1Q96EA4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPDL1Q96EA4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPDL1Q96EA4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDL1Q96EA4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDL1Q96EA4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDL1Q96EA4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDL1Q96EA4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDL1Q96EA4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPDL1Q96EA4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDL1Q96EA4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPDL1Q96EA4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDL1Q96EA4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDL1Q96EA4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDL1Q96EA4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDL1Q96EA4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDL1Q96EA4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPDL1Q96EA4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPDL1Q96EA4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPDL1Q96EA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDL1Q96EA4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDL1Q96EA4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPDL1Q96EA4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPDL1Q96EA4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPDL1Q96EA4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPDL1Q96EA4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms