Protein–RNA interactions for Protein: Q96D70

R3HDM4, R3H domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM4Q96D70 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM4Q96D70 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM4Q96D70 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM4Q96D70 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM4Q96D70 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM4Q96D70 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM4Q96D70 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM4Q96D70 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM4Q96D70 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM4Q96D70 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM4Q96D70 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM4Q96D70 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM4Q96D70 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HDM4Q96D70 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM4Q96D70 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HDM4Q96D70 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HDM4Q96D70 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HDM4Q96D70 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM4Q96D70 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM4Q96D70 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM4Q96D70 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HDM4Q96D70 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM4Q96D70 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM4Q96D70 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM4Q96D70 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM4Q96D70 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HDM4Q96D70 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM4Q96D70 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM4Q96D70 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM4Q96D70 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM4Q96D70 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM4Q96D70 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms