Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NMD3Q96D46 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NMD3Q96D46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NMD3Q96D46 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NMD3Q96D46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NMD3Q96D46 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NMD3Q96D46 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NMD3Q96D46 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMD3Q96D46 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NMD3Q96D46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NMD3Q96D46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMD3Q96D46 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMD3Q96D46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NMD3Q96D46 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NMD3Q96D46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMD3Q96D46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMD3Q96D46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NMD3Q96D46 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NMD3Q96D46 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NMD3Q96D46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NMD3Q96D46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NMD3Q96D46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMD3Q96D46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NMD3Q96D46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NMD3Q96D46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NMD3Q96D46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMD3Q96D46 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NMD3Q96D46 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NMD3Q96D46 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NMD3Q96D46 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NMD3Q96D46 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NMD3Q96D46 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMD3Q96D46 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMD3Q96D46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMD3Q96D46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMD3Q96D46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NMD3Q96D46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NMD3Q96D46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NMD3Q96D46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NMD3Q96D46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NMD3Q96D46 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NMD3Q96D46 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NMD3Q96D46 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NMD3Q96D46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NMD3Q96D46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NMD3Q96D46 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NMD3Q96D46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NMD3Q96D46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NMD3Q96D46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NMD3Q96D46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NMD3Q96D46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NMD3Q96D46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NMD3Q96D46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NMD3Q96D46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NMD3Q96D46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NMD3Q96D46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NMD3Q96D46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NMD3Q96D46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NMD3Q96D46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NMD3Q96D46 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NMD3Q96D46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NMD3Q96D46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms