Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGCDQ92629 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGCDQ92629 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGCDQ92629 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGCDQ92629 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGCDQ92629 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGCDQ92629 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGCDQ92629 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGCDQ92629 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGCDQ92629 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGCDQ92629 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGCDQ92629 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGCDQ92629 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGCDQ92629 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGCDQ92629 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGCDQ92629 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGCDQ92629 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGCDQ92629 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGCDQ92629 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCDQ92629 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGCDQ92629 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGCDQ92629 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGCDQ92629 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGCDQ92629 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGCDQ92629 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGCDQ92629 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGCDQ92629 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGCDQ92629 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGCDQ92629 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGCDQ92629 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGCDQ92629 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGCDQ92629 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGCDQ92629 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGCDQ92629 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGCDQ92629 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGCDQ92629 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGCDQ92629 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGCDQ92629 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGCDQ92629 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SGCDQ92629 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGCDQ92629 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGCDQ92629 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGCDQ92629 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGCDQ92629 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCDQ92629 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGCDQ92629 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGCDQ92629 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGCDQ92629 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGCDQ92629 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCDQ92629 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGCDQ92629 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGCDQ92629 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGCDQ92629 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGCDQ92629 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGCDQ92629 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SGCDQ92629 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGCDQ92629 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCDQ92629 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCDQ92629 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCDQ92629 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SGCDQ92629 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGCDQ92629 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGCDQ92629 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGCDQ92629 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGCDQ92629 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCDQ92629 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCDQ92629 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCDQ92629 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCDQ92629 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCDQ92629 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGCDQ92629 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGCDQ92629 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGCDQ92629 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms