Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS9Q8WXC6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS9Q8WXC6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS9Q8WXC6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS9Q8WXC6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS9Q8WXC6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS9Q8WXC6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS9Q8WXC6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS9Q8WXC6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS9Q8WXC6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS9Q8WXC6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS9Q8WXC6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS9Q8WXC6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS9Q8WXC6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS9Q8WXC6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS9Q8WXC6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS9Q8WXC6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS9Q8WXC6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COPS9Q8WXC6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COPS9Q8WXC6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS9Q8WXC6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS9Q8WXC6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS9Q8WXC6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS9Q8WXC6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS9Q8WXC6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPS9Q8WXC6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS9Q8WXC6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS9Q8WXC6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS9Q8WXC6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.8 ms