Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVZ7

RNF133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF133Q8WVZ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF133Q8WVZ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF133Q8WVZ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF133Q8WVZ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF133Q8WVZ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF133Q8WVZ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF133Q8WVZ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF133Q8WVZ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF133Q8WVZ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF133Q8WVZ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF133Q8WVZ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF133Q8WVZ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF133Q8WVZ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF133Q8WVZ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF133Q8WVZ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF133Q8WVZ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF133Q8WVZ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF133Q8WVZ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF133Q8WVZ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF133Q8WVZ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF133Q8WVZ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF133Q8WVZ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF133Q8WVZ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF133Q8WVZ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF133Q8WVZ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF133Q8WVZ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF133Q8WVZ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF133Q8WVZ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF133Q8WVZ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF133Q8WVZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF133Q8WVZ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF133Q8WVZ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF133Q8WVZ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF133Q8WVZ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF133Q8WVZ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF133Q8WVZ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF133Q8WVZ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF133Q8WVZ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF133Q8WVZ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF133Q8WVZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF133Q8WVZ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF133Q8WVZ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF133Q8WVZ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF133Q8WVZ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms