Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD5

RNF141, RING finger protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF141Q8WVD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF141Q8WVD5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF141Q8WVD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF141Q8WVD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF141Q8WVD5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF141Q8WVD5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF141Q8WVD5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF141Q8WVD5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF141Q8WVD5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF141Q8WVD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF141Q8WVD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF141Q8WVD5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF141Q8WVD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF141Q8WVD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF141Q8WVD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF141Q8WVD5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF141Q8WVD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF141Q8WVD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF141Q8WVD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF141Q8WVD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF141Q8WVD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF141Q8WVD5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF141Q8WVD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF141Q8WVD5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF141Q8WVD5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF141Q8WVD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF141Q8WVD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF141Q8WVD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF141Q8WVD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF141Q8WVD5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF141Q8WVD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF141Q8WVD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF141Q8WVD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF141Q8WVD5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF141Q8WVD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF141Q8WVD5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF141Q8WVD5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF141Q8WVD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF141Q8WVD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF141Q8WVD5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF141Q8WVD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF141Q8WVD5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF141Q8WVD5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF141Q8WVD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF141Q8WVD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF141Q8WVD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms