Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6DQ8NFY4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6DQ8NFY4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6DQ8NFY4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6DQ8NFY4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6DQ8NFY4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6DQ8NFY4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6DQ8NFY4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6DQ8NFY4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6DQ8NFY4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6DQ8NFY4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6DQ8NFY4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6DQ8NFY4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6DQ8NFY4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6DQ8NFY4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6DQ8NFY4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6DQ8NFY4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6DQ8NFY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA6DQ8NFY4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA6DQ8NFY4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA6DQ8NFY4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA6DQ8NFY4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA6DQ8NFY4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA6DQ8NFY4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA6DQ8NFY4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA6DQ8NFY4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA6DQ8NFY4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6DQ8NFY4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6DQ8NFY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6DQ8NFY4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6DQ8NFY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6DQ8NFY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6DQ8NFY4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6DQ8NFY4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6DQ8NFY4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA6DQ8NFY4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6DQ8NFY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6DQ8NFY4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6DQ8NFY4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6DQ8NFY4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6DQ8NFY4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6DQ8NFY4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6DQ8NFY4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6DQ8NFY4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6DQ8NFY4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA6DQ8NFY4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6DQ8NFY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms