Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA61

SPERT, Spermatid-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPERTQ8NA61 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPERTQ8NA61 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPERTQ8NA61 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPERTQ8NA61 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPERTQ8NA61 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPERTQ8NA61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPERTQ8NA61 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPERTQ8NA61 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPERTQ8NA61 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPERTQ8NA61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPERTQ8NA61 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPERTQ8NA61 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPERTQ8NA61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPERTQ8NA61 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPERTQ8NA61 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPERTQ8NA61 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPERTQ8NA61 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPERTQ8NA61 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPERTQ8NA61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPERTQ8NA61 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPERTQ8NA61 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPERTQ8NA61 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPERTQ8NA61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPERTQ8NA61 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPERTQ8NA61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPERTQ8NA61 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPERTQ8NA61 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPERTQ8NA61 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPERTQ8NA61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPERTQ8NA61 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPERTQ8NA61 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPERTQ8NA61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPERTQ8NA61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPERTQ8NA61 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPERTQ8NA61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPERTQ8NA61 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPERTQ8NA61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPERTQ8NA61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPERTQ8NA61 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPERTQ8NA61 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPERTQ8NA61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPERTQ8NA61 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPERTQ8NA61 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPERTQ8NA61 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms