Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NECAB1Q8N987 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NECAB1Q8N987 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NECAB1Q8N987 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NECAB1Q8N987 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NECAB1Q8N987 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NECAB1Q8N987 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NECAB1Q8N987 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NECAB1Q8N987 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NECAB1Q8N987 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NECAB1Q8N987 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NECAB1Q8N987 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NECAB1Q8N987 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NECAB1Q8N987 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NECAB1Q8N987 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NECAB1Q8N987 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NECAB1Q8N987 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NECAB1Q8N987 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NECAB1Q8N987 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NECAB1Q8N987 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NECAB1Q8N987 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NECAB1Q8N987 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NECAB1Q8N987 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NECAB1Q8N987 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NECAB1Q8N987 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NECAB1Q8N987 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NECAB1Q8N987 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NECAB1Q8N987 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NECAB1Q8N987 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NECAB1Q8N987 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NECAB1Q8N987 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NECAB1Q8N987 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NECAB1Q8N987 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NECAB1Q8N987 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NECAB1Q8N987 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NECAB1Q8N987 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NECAB1Q8N987 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NECAB1Q8N987 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NECAB1Q8N987 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NECAB1Q8N987 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NECAB1Q8N987 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NECAB1Q8N987 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NECAB1Q8N987 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NECAB1Q8N987 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NECAB1Q8N987 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NECAB1Q8N987 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NECAB1Q8N987 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NECAB1Q8N987 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NECAB1Q8N987 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NECAB1Q8N987 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NECAB1Q8N987 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NECAB1Q8N987 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NECAB1Q8N987 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NECAB1Q8N987 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NECAB1Q8N987 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NECAB1Q8N987 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms