Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
VPS8Q8N3P4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
VPS8Q8N3P4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
VPS8Q8N3P4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
VPS8Q8N3P4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
VPS8Q8N3P4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
VPS8Q8N3P4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
VPS8Q8N3P4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
VPS8Q8N3P4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
VPS8Q8N3P4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.69■■■■■ 4.9
VPS8Q8N3P4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
VPS8Q8N3P4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
VPS8Q8N3P4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
VPS8Q8N3P4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
VPS8Q8N3P4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
VPS8Q8N3P4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
VPS8Q8N3P4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
VPS8Q8N3P4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
VPS8Q8N3P4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
VPS8Q8N3P4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
VPS8Q8N3P4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
VPS8Q8N3P4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
VPS8Q8N3P4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
VPS8Q8N3P4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
VPS8Q8N3P4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
VPS8Q8N3P4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
VPS8Q8N3P4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
VPS8Q8N3P4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
VPS8Q8N3P4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
VPS8Q8N3P4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
VPS8Q8N3P4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
VPS8Q8N3P4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
VPS8Q8N3P4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
VPS8Q8N3P4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.07■■■■■ 4.81
VPS8Q8N3P4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
VPS8Q8N3P4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
VPS8Q8N3P4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
VPS8Q8N3P4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
VPS8Q8N3P4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
VPS8Q8N3P4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
VPS8Q8N3P4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
VPS8Q8N3P4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
VPS8Q8N3P4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
VPS8Q8N3P4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
VPS8Q8N3P4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
VPS8Q8N3P4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
VPS8Q8N3P4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
VPS8Q8N3P4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
VPS8Q8N3P4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
VPS8Q8N3P4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
VPS8Q8N3P4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
VPS8Q8N3P4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
VPS8Q8N3P4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
VPS8Q8N3P4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
VPS8Q8N3P4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
VPS8Q8N3P4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
VPS8Q8N3P4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
VPS8Q8N3P4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
VPS8Q8N3P4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
VPS8Q8N3P4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
VPS8Q8N3P4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
VPS8Q8N3P4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
VPS8Q8N3P4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
VPS8Q8N3P4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
VPS8Q8N3P4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.43■■■■■ 4.7
VPS8Q8N3P4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
VPS8Q8N3P4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
VPS8Q8N3P4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
VPS8Q8N3P4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
VPS8Q8N3P4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
VPS8Q8N3P4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
VPS8Q8N3P4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
VPS8Q8N3P4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
VPS8Q8N3P4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
VPS8Q8N3P4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC44.31■■■■■ 4.68
VPS8Q8N3P4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
VPS8Q8N3P4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
VPS8Q8N3P4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
VPS8Q8N3P4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
VPS8Q8N3P4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.25■■■■■ 4.67
VPS8Q8N3P4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
VPS8Q8N3P4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
VPS8Q8N3P4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
VPS8Q8N3P4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
VPS8Q8N3P4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
VPS8Q8N3P4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms