Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.47■■■■■ 6.31
VPS8Q8N3P4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.37■■■■■ 6.13
VPS8Q8N3P4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
VPS8Q8N3P4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.83■■■■■ 6.05
VPS8Q8N3P4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.77■■■■■ 6.04
VPS8Q8N3P4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.74■■■■■ 6.03
VPS8Q8N3P4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.71■■■■■ 6.03
VPS8Q8N3P4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.81■■■■■ 5.88
VPS8Q8N3P4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.71■■■■■ 5.87
VPS8Q8N3P4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
VPS8Q8N3P4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
VPS8Q8N3P4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.9■■■■■ 5.74
VPS8Q8N3P4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.86■■■■■ 5.73
VPS8Q8N3P4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
VPS8Q8N3P4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
VPS8Q8N3P4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.54■■■■■ 5.68
VPS8Q8N3P4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.54■■■■■ 5.68
VPS8Q8N3P4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.54■■■■■ 5.68
VPS8Q8N3P4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
VPS8Q8N3P4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.22■■■■■ 5.63
VPS8Q8N3P4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
VPS8Q8N3P4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
VPS8Q8N3P4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
VPS8Q8N3P4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
VPS8Q8N3P4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
VPS8Q8N3P4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
VPS8Q8N3P4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
VPS8Q8N3P4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
VPS8Q8N3P4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
VPS8Q8N3P4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
VPS8Q8N3P4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
VPS8Q8N3P4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
VPS8Q8N3P4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.64■■■■■ 5.38
VPS8Q8N3P4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.56■■■■■ 5.36
VPS8Q8N3P4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
VPS8Q8N3P4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
VPS8Q8N3P4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
VPS8Q8N3P4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
VPS8Q8N3P4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
VPS8Q8N3P4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.16■■■■■ 5.3
VPS8Q8N3P4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
VPS8Q8N3P4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.13■■■■■ 5.3
VPS8Q8N3P4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
VPS8Q8N3P4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.98■■■■■ 5.27
VPS8Q8N3P4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.98■■■■■ 5.27
VPS8Q8N3P4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
VPS8Q8N3P4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC47.92■■■■■ 5.26
VPS8Q8N3P4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.75■■■■■ 5.23
VPS8Q8N3P4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
VPS8Q8N3P4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
VPS8Q8N3P4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
VPS8Q8N3P4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
VPS8Q8N3P4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
VPS8Q8N3P4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
VPS8Q8N3P4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
VPS8Q8N3P4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
VPS8Q8N3P4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
VPS8Q8N3P4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.31■■■■■ 5.16
VPS8Q8N3P4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
VPS8Q8N3P4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
VPS8Q8N3P4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
VPS8Q8N3P4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
VPS8Q8N3P4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
VPS8Q8N3P4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
VPS8Q8N3P4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
VPS8Q8N3P4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.82■■■■■ 5.09
VPS8Q8N3P4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
VPS8Q8N3P4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
VPS8Q8N3P4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
VPS8Q8N3P4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
VPS8Q8N3P4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
VPS8Q8N3P4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
VPS8Q8N3P4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
VPS8Q8N3P4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
VPS8Q8N3P4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
VPS8Q8N3P4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
VPS8Q8N3P4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
VPS8Q8N3P4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
VPS8Q8N3P4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
VPS8Q8N3P4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
VPS8Q8N3P4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
VPS8Q8N3P4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
VPS8Q8N3P4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
VPS8Q8N3P4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
VPS8Q8N3P4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
VPS8Q8N3P4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
VPS8Q8N3P4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
VPS8Q8N3P4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
VPS8Q8N3P4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
VPS8Q8N3P4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
VPS8Q8N3P4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
VPS8Q8N3P4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
VPS8Q8N3P4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
VPS8Q8N3P4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
VPS8Q8N3P4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
VPS8Q8N3P4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
VPS8Q8N3P4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
VPS8Q8N3P4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
VPS8Q8N3P4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms