Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA5Q8N114 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHISA5Q8N114 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA5Q8N114 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHISA5Q8N114 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA5Q8N114 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA5Q8N114 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA5Q8N114 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA5Q8N114 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHISA5Q8N114 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHISA5Q8N114 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHISA5Q8N114 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHISA5Q8N114 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA5Q8N114 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA5Q8N114 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHISA5Q8N114 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHISA5Q8N114 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA5Q8N114 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHISA5Q8N114 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA5Q8N114 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHISA5Q8N114 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHISA5Q8N114 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHISA5Q8N114 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHISA5Q8N114 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA5Q8N114 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA5Q8N114 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA5Q8N114 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA5Q8N114 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHISA5Q8N114 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA5Q8N114 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA5Q8N114 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA5Q8N114 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA5Q8N114 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA5Q8N114 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHISA5Q8N114 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA5Q8N114 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHISA5Q8N114 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHISA5Q8N114 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHISA5Q8N114 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHISA5Q8N114 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHISA5Q8N114 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHISA5Q8N114 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHISA5Q8N114 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA5Q8N114 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA5Q8N114 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA5Q8N114 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA5Q8N114 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHISA5Q8N114 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHISA5Q8N114 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA5Q8N114 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA5Q8N114 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA5Q8N114 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA5Q8N114 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA5Q8N114 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA5Q8N114 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHISA5Q8N114 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA5Q8N114 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHISA5Q8N114 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHISA5Q8N114 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHISA5Q8N114 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA5Q8N114 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA5Q8N114 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA5Q8N114 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA5Q8N114 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA5Q8N114 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA5Q8N114 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SHISA5Q8N114 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA5Q8N114 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA5Q8N114 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA5Q8N114 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA5Q8N114 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA5Q8N114 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHISA5Q8N114 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms