Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHISA5Q8N114 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHISA5Q8N114 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SHISA5Q8N114 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHISA5Q8N114 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHISA5Q8N114 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHISA5Q8N114 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHISA5Q8N114 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHISA5Q8N114 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA5Q8N114 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHISA5Q8N114 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHISA5Q8N114 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHISA5Q8N114 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHISA5Q8N114 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHISA5Q8N114 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHISA5Q8N114 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA5Q8N114 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHISA5Q8N114 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHISA5Q8N114 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHISA5Q8N114 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA5Q8N114 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHISA5Q8N114 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA5Q8N114 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHISA5Q8N114 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHISA5Q8N114 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHISA5Q8N114 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHISA5Q8N114 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHISA5Q8N114 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA5Q8N114 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA5Q8N114 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHISA5Q8N114 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHISA5Q8N114 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHISA5Q8N114 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHISA5Q8N114 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHISA5Q8N114 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHISA5Q8N114 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHISA5Q8N114 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHISA5Q8N114 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA5Q8N114 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHISA5Q8N114 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHISA5Q8N114 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHISA5Q8N114 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHISA5Q8N114 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHISA5Q8N114 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHISA5Q8N114 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHISA5Q8N114 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA5Q8N114 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA5Q8N114 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA5Q8N114 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA5Q8N114 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA5Q8N114 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA5Q8N114 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHISA5Q8N114 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHISA5Q8N114 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHISA5Q8N114 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHISA5Q8N114 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHISA5Q8N114 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA5Q8N114 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA5Q8N114 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA5Q8N114 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHISA5Q8N114 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA5Q8N114 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA5Q8N114 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHISA5Q8N114 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHISA5Q8N114 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHISA5Q8N114 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA5Q8N114 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA5Q8N114 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHISA5Q8N114 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHISA5Q8N114 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHISA5Q8N114 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHISA5Q8N114 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHISA5Q8N114 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA5Q8N114 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA5Q8N114 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA5Q8N114 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA5Q8N114 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA5Q8N114 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA5Q8N114 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHISA5Q8N114 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA5Q8N114 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA5Q8N114 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA5Q8N114 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA5Q8N114 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA5Q8N114 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA5Q8N114 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHISA5Q8N114 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA5Q8N114 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA5Q8N114 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHISA5Q8N114 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA5Q8N114 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHISA5Q8N114 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHISA5Q8N114 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA5Q8N114 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHISA5Q8N114 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHISA5Q8N114 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHISA5Q8N114 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA5Q8N114 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA5Q8N114 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHISA5Q8N114 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms