Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT9Q86SS6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT9Q86SS6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT9Q86SS6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT9Q86SS6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT9Q86SS6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT9Q86SS6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT9Q86SS6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT9Q86SS6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT9Q86SS6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT9Q86SS6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT9Q86SS6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT9Q86SS6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT9Q86SS6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT9Q86SS6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT9Q86SS6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT9Q86SS6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT9Q86SS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT9Q86SS6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT9Q86SS6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT9Q86SS6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT9Q86SS6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT9Q86SS6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT9Q86SS6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT9Q86SS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT9Q86SS6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT9Q86SS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT9Q86SS6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT9Q86SS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT9Q86SS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT9Q86SS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT9Q86SS6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT9Q86SS6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT9Q86SS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT9Q86SS6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT9Q86SS6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT9Q86SS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT9Q86SS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT9Q86SS6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT9Q86SS6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT9Q86SS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT9Q86SS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT9Q86SS6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT9Q86SS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms