Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMUB2Q71RG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMUB2Q71RG4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMUB2Q71RG4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMUB2Q71RG4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMUB2Q71RG4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMUB2Q71RG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMUB2Q71RG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMUB2Q71RG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMUB2Q71RG4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMUB2Q71RG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMUB2Q71RG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMUB2Q71RG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMUB2Q71RG4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMUB2Q71RG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMUB2Q71RG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMUB2Q71RG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMUB2Q71RG4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMUB2Q71RG4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMUB2Q71RG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMUB2Q71RG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMUB2Q71RG4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMUB2Q71RG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMUB2Q71RG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMUB2Q71RG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMUB2Q71RG4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMUB2Q71RG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMUB2Q71RG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMUB2Q71RG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMUB2Q71RG4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMUB2Q71RG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMUB2Q71RG4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMUB2Q71RG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMUB2Q71RG4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMUB2Q71RG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMUB2Q71RG4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMUB2Q71RG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMUB2Q71RG4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMUB2Q71RG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMUB2Q71RG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMUB2Q71RG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMUB2Q71RG4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMUB2Q71RG4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMUB2Q71RG4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMUB2Q71RG4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMUB2Q71RG4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMUB2Q71RG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMUB2Q71RG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMUB2Q71RG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMUB2Q71RG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMUB2Q71RG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMUB2Q71RG4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMUB2Q71RG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms