Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFXN4Q6P4A7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFXN4Q6P4A7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFXN4Q6P4A7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFXN4Q6P4A7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFXN4Q6P4A7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFXN4Q6P4A7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFXN4Q6P4A7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFXN4Q6P4A7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFXN4Q6P4A7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFXN4Q6P4A7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN4Q6P4A7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFXN4Q6P4A7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFXN4Q6P4A7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFXN4Q6P4A7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFXN4Q6P4A7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFXN4Q6P4A7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFXN4Q6P4A7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFXN4Q6P4A7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFXN4Q6P4A7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN4Q6P4A7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN4Q6P4A7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFXN4Q6P4A7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFXN4Q6P4A7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFXN4Q6P4A7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN4Q6P4A7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN4Q6P4A7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN4Q6P4A7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFXN4Q6P4A7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFXN4Q6P4A7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFXN4Q6P4A7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFXN4Q6P4A7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFXN4Q6P4A7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFXN4Q6P4A7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFXN4Q6P4A7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFXN4Q6P4A7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFXN4Q6P4A7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN4Q6P4A7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFXN4Q6P4A7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFXN4Q6P4A7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFXN4Q6P4A7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFXN4Q6P4A7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFXN4Q6P4A7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFXN4Q6P4A7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFXN4Q6P4A7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFXN4Q6P4A7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFXN4Q6P4A7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFXN4Q6P4A7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFXN4Q6P4A7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFXN4Q6P4A7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFXN4Q6P4A7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFXN4Q6P4A7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFXN4Q6P4A7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN4Q6P4A7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN4Q6P4A7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN4Q6P4A7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFXN4Q6P4A7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN4Q6P4A7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFXN4Q6P4A7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFXN4Q6P4A7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFXN4Q6P4A7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFXN4Q6P4A7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFXN4Q6P4A7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFXN4Q6P4A7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms