Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD13Q5VXD3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD13Q5VXD3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD13Q5VXD3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD13Q5VXD3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD13Q5VXD3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD13Q5VXD3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD13Q5VXD3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD13Q5VXD3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD13Q5VXD3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD13Q5VXD3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD13Q5VXD3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD13Q5VXD3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD13Q5VXD3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD13Q5VXD3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD13Q5VXD3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD13Q5VXD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD13Q5VXD3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD13Q5VXD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD13Q5VXD3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD13Q5VXD3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD13Q5VXD3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD13Q5VXD3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD13Q5VXD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD13Q5VXD3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD13Q5VXD3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD13Q5VXD3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD13Q5VXD3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms