Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CROCCQ5TZA2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CROCCQ5TZA2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CROCCQ5TZA2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CROCCQ5TZA2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CROCCQ5TZA2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CROCCQ5TZA2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CROCCQ5TZA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CROCCQ5TZA2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CROCCQ5TZA2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CROCCQ5TZA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CROCCQ5TZA2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCCQ5TZA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CROCCQ5TZA2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCCQ5TZA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCCQ5TZA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCCQ5TZA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCCQ5TZA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCCQ5TZA2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCCQ5TZA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCCQ5TZA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCCQ5TZA2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCCQ5TZA2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCCQ5TZA2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCCQ5TZA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCCQ5TZA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CROCCQ5TZA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CROCCQ5TZA2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CROCCQ5TZA2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CROCCQ5TZA2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CROCCQ5TZA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CROCCQ5TZA2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CROCCQ5TZA2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CROCCQ5TZA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CROCCQ5TZA2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CROCCQ5TZA2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CROCCQ5TZA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CROCCQ5TZA2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CROCCQ5TZA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CROCCQ5TZA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CROCCQ5TZA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CROCCQ5TZA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CROCCQ5TZA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CROCCQ5TZA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CROCCQ5TZA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CROCCQ5TZA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CROCCQ5TZA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CROCCQ5TZA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CROCCQ5TZA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CROCCQ5TZA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CROCCQ5TZA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CROCCQ5TZA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CROCCQ5TZA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CROCCQ5TZA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CROCCQ5TZA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CROCCQ5TZA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CROCCQ5TZA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CROCCQ5TZA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CROCCQ5TZA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CROCCQ5TZA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CROCCQ5TZA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms