Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMG4Q5JS54 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMG4Q5JS54 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMG4Q5JS54 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMG4Q5JS54 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMG4Q5JS54 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMG4Q5JS54 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMG4Q5JS54 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMG4Q5JS54 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMG4Q5JS54 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMG4Q5JS54 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMG4Q5JS54 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMG4Q5JS54 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMG4Q5JS54 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMG4Q5JS54 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMG4Q5JS54 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMG4Q5JS54 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMG4Q5JS54 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMG4Q5JS54 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMG4Q5JS54 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMG4Q5JS54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMG4Q5JS54 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMG4Q5JS54 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMG4Q5JS54 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMG4Q5JS54 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMG4Q5JS54 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMG4Q5JS54 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMG4Q5JS54 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMG4Q5JS54 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMG4Q5JS54 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMG4Q5JS54 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMG4Q5JS54 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMG4Q5JS54 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMG4Q5JS54 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMG4Q5JS54 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMG4Q5JS54 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMG4Q5JS54 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMG4Q5JS54 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMG4Q5JS54 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMG4Q5JS54 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMG4Q5JS54 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMG4Q5JS54 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMG4Q5JS54 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMG4Q5JS54 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms