Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf46Q504U0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf46Q504U0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf46Q504U0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf46Q504U0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4orf46Q504U0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf46Q504U0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf46Q504U0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf46Q504U0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf46Q504U0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf46Q504U0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf46Q504U0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4orf46Q504U0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4orf46Q504U0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf46Q504U0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4orf46Q504U0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf46Q504U0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf46Q504U0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf46Q504U0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf46Q504U0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf46Q504U0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf46Q504U0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf46Q504U0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf46Q504U0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf46Q504U0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf46Q504U0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf46Q504U0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4orf46Q504U0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf46Q504U0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf46Q504U0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf46Q504U0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf46Q504U0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4orf46Q504U0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf46Q504U0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf46Q504U0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4orf46Q504U0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4orf46Q504U0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf46Q504U0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf46Q504U0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4orf46Q504U0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf46Q504U0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf46Q504U0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf46Q504U0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf46Q504U0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf46Q504U0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf46Q504U0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf46Q504U0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4orf46Q504U0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4orf46Q504U0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf46Q504U0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf46Q504U0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf46Q504U0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf46Q504U0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf46Q504U0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms