Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C4orf46Q504U0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C4orf46Q504U0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4orf46Q504U0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4orf46Q504U0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4orf46Q504U0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4orf46Q504U0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4orf46Q504U0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4orf46Q504U0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4orf46Q504U0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4orf46Q504U0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4orf46Q504U0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4orf46Q504U0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4orf46Q504U0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4orf46Q504U0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C4orf46Q504U0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4orf46Q504U0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4orf46Q504U0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4orf46Q504U0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4orf46Q504U0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4orf46Q504U0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C4orf46Q504U0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf46Q504U0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf46Q504U0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4orf46Q504U0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4orf46Q504U0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4orf46Q504U0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4orf46Q504U0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4orf46Q504U0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf46Q504U0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C4orf46Q504U0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C4orf46Q504U0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4orf46Q504U0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4orf46Q504U0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4orf46Q504U0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C4orf46Q504U0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4orf46Q504U0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C4orf46Q504U0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4orf46Q504U0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf46Q504U0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4orf46Q504U0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4orf46Q504U0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4orf46Q504U0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf46Q504U0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf46Q504U0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf46Q504U0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf46Q504U0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf46Q504U0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf46Q504U0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf46Q504U0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4orf46Q504U0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4orf46Q504U0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4orf46Q504U0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C4orf46Q504U0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf46Q504U0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf46Q504U0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C4orf46Q504U0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4orf46Q504U0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf46Q504U0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf46Q504U0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf46Q504U0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4orf46Q504U0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf46Q504U0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf46Q504U0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf46Q504U0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf46Q504U0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4orf46Q504U0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf46Q504U0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf46Q504U0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4orf46Q504U0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf46Q504U0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf46Q504U0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf46Q504U0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4orf46Q504U0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf46Q504U0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf46Q504U0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4orf46Q504U0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4orf46Q504U0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4orf46Q504U0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf46Q504U0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf46Q504U0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf46Q504U0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf46Q504U0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf46Q504U0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C4orf46Q504U0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf46Q504U0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf46Q504U0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf46Q504U0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf46Q504U0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf46Q504U0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf46Q504U0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf46Q504U0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf46Q504U0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms