Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5N1

ABCA11P, Putative ATP-binding cassette sub-family A member 11, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA11PQ4W5N1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCA11PQ4W5N1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA11PQ4W5N1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCA11PQ4W5N1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCA11PQ4W5N1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCA11PQ4W5N1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCA11PQ4W5N1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCA11PQ4W5N1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCA11PQ4W5N1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCA11PQ4W5N1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCA11PQ4W5N1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCA11PQ4W5N1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCA11PQ4W5N1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCA11PQ4W5N1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCA11PQ4W5N1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCA11PQ4W5N1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCA11PQ4W5N1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCA11PQ4W5N1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCA11PQ4W5N1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCA11PQ4W5N1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCA11PQ4W5N1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCA11PQ4W5N1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCA11PQ4W5N1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCA11PQ4W5N1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCA11PQ4W5N1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCA11PQ4W5N1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCA11PQ4W5N1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCA11PQ4W5N1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCA11PQ4W5N1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCA11PQ4W5N1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCA11PQ4W5N1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCA11PQ4W5N1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCA11PQ4W5N1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCA11PQ4W5N1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCA11PQ4W5N1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA11PQ4W5N1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA11PQ4W5N1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA11PQ4W5N1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA11PQ4W5N1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA11PQ4W5N1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms