Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LONRF3Q496Y0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LONRF3Q496Y0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LONRF3Q496Y0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LONRF3Q496Y0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LONRF3Q496Y0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LONRF3Q496Y0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LONRF3Q496Y0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LONRF3Q496Y0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LONRF3Q496Y0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LONRF3Q496Y0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LONRF3Q496Y0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LONRF3Q496Y0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LONRF3Q496Y0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LONRF3Q496Y0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LONRF3Q496Y0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LONRF3Q496Y0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LONRF3Q496Y0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LONRF3Q496Y0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LONRF3Q496Y0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LONRF3Q496Y0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LONRF3Q496Y0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LONRF3Q496Y0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
LONRF3Q496Y0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LONRF3Q496Y0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LONRF3Q496Y0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LONRF3Q496Y0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LONRF3Q496Y0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LONRF3Q496Y0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LONRF3Q496Y0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LONRF3Q496Y0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LONRF3Q496Y0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LONRF3Q496Y0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LONRF3Q496Y0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LONRF3Q496Y0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LONRF3Q496Y0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LONRF3Q496Y0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LONRF3Q496Y0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LONRF3Q496Y0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LONRF3Q496Y0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LONRF3Q496Y0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LONRF3Q496Y0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LONRF3Q496Y0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LONRF3Q496Y0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LONRF3Q496Y0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LONRF3Q496Y0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LONRF3Q496Y0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LONRF3Q496Y0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LONRF3Q496Y0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LONRF3Q496Y0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LONRF3Q496Y0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LONRF3Q496Y0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LONRF3Q496Y0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
LONRF3Q496Y0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
LONRF3Q496Y0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LONRF3Q496Y0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LONRF3Q496Y0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms