Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
KRT24Q2M2I5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KRT24Q2M2I5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KRT24Q2M2I5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KRT24Q2M2I5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KRT24Q2M2I5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KRT24Q2M2I5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KRT24Q2M2I5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KRT24Q2M2I5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
KRT24Q2M2I5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KRT24Q2M2I5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KRT24Q2M2I5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KRT24Q2M2I5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KRT24Q2M2I5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KRT24Q2M2I5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KRT24Q2M2I5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
KRT24Q2M2I5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
KRT24Q2M2I5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KRT24Q2M2I5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KRT24Q2M2I5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KRT24Q2M2I5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KRT24Q2M2I5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
KRT24Q2M2I5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KRT24Q2M2I5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KRT24Q2M2I5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KRT24Q2M2I5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KRT24Q2M2I5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KRT24Q2M2I5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KRT24Q2M2I5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KRT24Q2M2I5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
KRT24Q2M2I5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KRT24Q2M2I5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KRT24Q2M2I5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KRT24Q2M2I5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KRT24Q2M2I5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KRT24Q2M2I5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KRT24Q2M2I5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KRT24Q2M2I5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KRT24Q2M2I5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KRT24Q2M2I5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KRT24Q2M2I5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KRT24Q2M2I5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KRT24Q2M2I5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KRT24Q2M2I5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KRT24Q2M2I5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KRT24Q2M2I5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KRT24Q2M2I5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KRT24Q2M2I5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KRT24Q2M2I5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KRT24Q2M2I5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KRT24Q2M2I5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
KRT24Q2M2I5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KRT24Q2M2I5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KRT24Q2M2I5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KRT24Q2M2I5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KRT24Q2M2I5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KRT24Q2M2I5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KRT24Q2M2I5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KRT24Q2M2I5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KRT24Q2M2I5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KRT24Q2M2I5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KRT24Q2M2I5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KRT24Q2M2I5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KRT24Q2M2I5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KRT24Q2M2I5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KRT24Q2M2I5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KRT24Q2M2I5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KRT24Q2M2I5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KRT24Q2M2I5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KRT24Q2M2I5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KRT24Q2M2I5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KRT24Q2M2I5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KRT24Q2M2I5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KRT24Q2M2I5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
KRT24Q2M2I5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KRT24Q2M2I5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KRT24Q2M2I5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KRT24Q2M2I5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KRT24Q2M2I5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KRT24Q2M2I5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KRT24Q2M2I5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KRT24Q2M2I5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KRT24Q2M2I5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KRT24Q2M2I5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KRT24Q2M2I5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KRT24Q2M2I5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KRT24Q2M2I5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KRT24Q2M2I5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms