Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.55■■■■■ 4.72
KRT24Q2M2I5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
KRT24Q2M2I5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
KRT24Q2M2I5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
KRT24Q2M2I5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
KRT24Q2M2I5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
KRT24Q2M2I5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
KRT24Q2M2I5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
KRT24Q2M2I5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KRT24Q2M2I5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KRT24Q2M2I5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
KRT24Q2M2I5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
KRT24Q2M2I5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
KRT24Q2M2I5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
KRT24Q2M2I5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
KRT24Q2M2I5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
KRT24Q2M2I5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
KRT24Q2M2I5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
KRT24Q2M2I5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
KRT24Q2M2I5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
KRT24Q2M2I5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
KRT24Q2M2I5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
KRT24Q2M2I5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KRT24Q2M2I5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
KRT24Q2M2I5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KRT24Q2M2I5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
KRT24Q2M2I5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
KRT24Q2M2I5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
KRT24Q2M2I5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
KRT24Q2M2I5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
KRT24Q2M2I5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
KRT24Q2M2I5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
KRT24Q2M2I5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
KRT24Q2M2I5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KRT24Q2M2I5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
KRT24Q2M2I5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
KRT24Q2M2I5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
KRT24Q2M2I5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
KRT24Q2M2I5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.91
KRT24Q2M2I5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KRT24Q2M2I5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KRT24Q2M2I5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
KRT24Q2M2I5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KRT24Q2M2I5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
KRT24Q2M2I5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KRT24Q2M2I5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
KRT24Q2M2I5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KRT24Q2M2I5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
KRT24Q2M2I5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
KRT24Q2M2I5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KRT24Q2M2I5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KRT24Q2M2I5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KRT24Q2M2I5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KRT24Q2M2I5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
KRT24Q2M2I5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KRT24Q2M2I5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
KRT24Q2M2I5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
KRT24Q2M2I5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
KRT24Q2M2I5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
KRT24Q2M2I5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KRT24Q2M2I5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
KRT24Q2M2I5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KRT24Q2M2I5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KRT24Q2M2I5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KRT24Q2M2I5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KRT24Q2M2I5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
KRT24Q2M2I5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
KRT24Q2M2I5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KRT24Q2M2I5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KRT24Q2M2I5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KRT24Q2M2I5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KRT24Q2M2I5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KRT24Q2M2I5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KRT24Q2M2I5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
KRT24Q2M2I5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KRT24Q2M2I5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KRT24Q2M2I5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KRT24Q2M2I5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KRT24Q2M2I5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KRT24Q2M2I5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KRT24Q2M2I5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
KRT24Q2M2I5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KRT24Q2M2I5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KRT24Q2M2I5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KRT24Q2M2I5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KRT24Q2M2I5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KRT24Q2M2I5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KRT24Q2M2I5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
KRT24Q2M2I5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
KRT24Q2M2I5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KRT24Q2M2I5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KRT24Q2M2I5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KRT24Q2M2I5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms