Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL8BQ17RB0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL8BQ17RB0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL8BQ17RB0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL8BQ17RB0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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