Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBBP7Q16576 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBBP7Q16576 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBBP7Q16576 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBBP7Q16576 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBBP7Q16576 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP7Q16576 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP7Q16576 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBBP7Q16576 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBBP7Q16576 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBBP7Q16576 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBBP7Q16576 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBBP7Q16576 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBBP7Q16576 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBBP7Q16576 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBBP7Q16576 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBBP7Q16576 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBBP7Q16576 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBBP7Q16576 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP7Q16576 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBBP7Q16576 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP7Q16576 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBBP7Q16576 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBBP7Q16576 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP7Q16576 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP7Q16576 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBBP7Q16576 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBBP7Q16576 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBBP7Q16576 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBBP7Q16576 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP7Q16576 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP7Q16576 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBBP7Q16576 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP7Q16576 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBBP7Q16576 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP7Q16576 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP7Q16576 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBBP7Q16576 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBBP7Q16576 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP7Q16576 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBBP7Q16576 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP7Q16576 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBBP7Q16576 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP7Q16576 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP7Q16576 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBBP7Q16576 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBBP7Q16576 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP7Q16576 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBBP7Q16576 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBBP7Q16576 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP7Q16576 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP7Q16576 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP7Q16576 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP7Q16576 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP7Q16576 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP7Q16576 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBBP7Q16576 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBBP7Q16576 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBBP7Q16576 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP7Q16576 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP7Q16576 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP7Q16576 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP7Q16576 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms