Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
AP3B2Q13367 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AP3B2Q13367 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AP3B2Q13367 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
AP3B2Q13367 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AP3B2Q13367 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
AP3B2Q13367 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
AP3B2Q13367 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
AP3B2Q13367 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AP3B2Q13367 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
AP3B2Q13367 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AP3B2Q13367 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
AP3B2Q13367 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
AP3B2Q13367 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
AP3B2Q13367 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
AP3B2Q13367 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
AP3B2Q13367 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AP3B2Q13367 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
AP3B2Q13367 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AP3B2Q13367 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
AP3B2Q13367 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
AP3B2Q13367 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AP3B2Q13367 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
AP3B2Q13367 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
AP3B2Q13367 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
AP3B2Q13367 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
AP3B2Q13367 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
AP3B2Q13367 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
AP3B2Q13367 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
AP3B2Q13367 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
AP3B2Q13367 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
AP3B2Q13367 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
AP3B2Q13367 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
AP3B2Q13367 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
AP3B2Q13367 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AP3B2Q13367 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AP3B2Q13367 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AP3B2Q13367 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AP3B2Q13367 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
AP3B2Q13367 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
AP3B2Q13367 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
AP3B2Q13367 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AP3B2Q13367 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AP3B2Q13367 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AP3B2Q13367 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AP3B2Q13367 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AP3B2Q13367 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AP3B2Q13367 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AP3B2Q13367 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
AP3B2Q13367 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AP3B2Q13367 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AP3B2Q13367 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AP3B2Q13367 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AP3B2Q13367 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AP3B2Q13367 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
AP3B2Q13367 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AP3B2Q13367 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AP3B2Q13367 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AP3B2Q13367 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AP3B2Q13367 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AP3B2Q13367 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AP3B2Q13367 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AP3B2Q13367 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
AP3B2Q13367 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
AP3B2Q13367 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
AP3B2Q13367 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
AP3B2Q13367 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AP3B2Q13367 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
AP3B2Q13367 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
AP3B2Q13367 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
AP3B2Q13367 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
AP3B2Q13367 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
AP3B2Q13367 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AP3B2Q13367 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
AP3B2Q13367 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
AP3B2Q13367 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AP3B2Q13367 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
AP3B2Q13367 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
AP3B2Q13367 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
AP3B2Q13367 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AP3B2Q13367 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
AP3B2Q13367 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AP3B2Q13367 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
AP3B2Q13367 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
AP3B2Q13367 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
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