Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
AP3B2Q13367 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
AP3B2Q13367 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
AP3B2Q13367 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
AP3B2Q13367 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
AP3B2Q13367 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
AP3B2Q13367 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
AP3B2Q13367 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
AP3B2Q13367 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
AP3B2Q13367 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
AP3B2Q13367 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
AP3B2Q13367 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
AP3B2Q13367 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
AP3B2Q13367 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
AP3B2Q13367 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
AP3B2Q13367 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
AP3B2Q13367 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
AP3B2Q13367 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
AP3B2Q13367 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
AP3B2Q13367 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
AP3B2Q13367 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
AP3B2Q13367 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
AP3B2Q13367 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
AP3B2Q13367 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
AP3B2Q13367 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
AP3B2Q13367 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AP3B2Q13367 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
AP3B2Q13367 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
AP3B2Q13367 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
AP3B2Q13367 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AP3B2Q13367 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AP3B2Q13367 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
AP3B2Q13367 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
AP3B2Q13367 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
AP3B2Q13367 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
AP3B2Q13367 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
AP3B2Q13367 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
AP3B2Q13367 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
AP3B2Q13367 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
AP3B2Q13367 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
AP3B2Q13367 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
AP3B2Q13367 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
AP3B2Q13367 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
AP3B2Q13367 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
AP3B2Q13367 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
AP3B2Q13367 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
AP3B2Q13367 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
AP3B2Q13367 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
AP3B2Q13367 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
AP3B2Q13367 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
AP3B2Q13367 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
AP3B2Q13367 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
AP3B2Q13367 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
AP3B2Q13367 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
AP3B2Q13367 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
AP3B2Q13367 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
AP3B2Q13367 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
AP3B2Q13367 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
AP3B2Q13367 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
AP3B2Q13367 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
AP3B2Q13367 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
AP3B2Q13367 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AP3B2Q13367 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
AP3B2Q13367 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AP3B2Q13367 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AP3B2Q13367 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AP3B2Q13367 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
AP3B2Q13367 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
AP3B2Q13367 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
AP3B2Q13367 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
AP3B2Q13367 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AP3B2Q13367 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
AP3B2Q13367 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
AP3B2Q13367 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
AP3B2Q13367 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
AP3B2Q13367 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AP3B2Q13367 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AP3B2Q13367 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
AP3B2Q13367 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
AP3B2Q13367 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
AP3B2Q13367 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
AP3B2Q13367 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
AP3B2Q13367 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
AP3B2Q13367 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
AP3B2Q13367 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
AP3B2Q13367 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
AP3B2Q13367 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
AP3B2Q13367 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
AP3B2Q13367 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AP3B2Q13367 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
AP3B2Q13367 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
AP3B2Q13367 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
AP3B2Q13367 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
AP3B2Q13367 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
AP3B2Q13367 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
AP3B2Q13367 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
AP3B2Q13367 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
AP3B2Q13367 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
AP3B2Q13367 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
AP3B2Q13367 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
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