Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAF1Q13077 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAF1Q13077 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAF1Q13077 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAF1Q13077 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAF1Q13077 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAF1Q13077 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAF1Q13077 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAF1Q13077 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TRAF1Q13077 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAF1Q13077 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAF1Q13077 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAF1Q13077 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAF1Q13077 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRAF1Q13077 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAF1Q13077 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAF1Q13077 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAF1Q13077 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAF1Q13077 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAF1Q13077 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAF1Q13077 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRAF1Q13077 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAF1Q13077 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAF1Q13077 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAF1Q13077 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAF1Q13077 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAF1Q13077 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAF1Q13077 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAF1Q13077 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAF1Q13077 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAF1Q13077 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAF1Q13077 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAF1Q13077 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAF1Q13077 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAF1Q13077 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAF1Q13077 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAF1Q13077 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAF1Q13077 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAF1Q13077 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAF1Q13077 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAF1Q13077 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAF1Q13077 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAF1Q13077 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAF1Q13077 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAF1Q13077 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRAF1Q13077 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRAF1Q13077 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAF1Q13077 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAF1Q13077 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAF1Q13077 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAF1Q13077 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAF1Q13077 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAF1Q13077 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAF1Q13077 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TRAF1Q13077 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAF1Q13077 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAF1Q13077 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAF1Q13077 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAF1Q13077 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAF1Q13077 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAF1Q13077 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAF1Q13077 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAF1Q13077 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAF1Q13077 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRAF1Q13077 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAF1Q13077 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAF1Q13077 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAF1Q13077 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAF1Q13077 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAF1Q13077 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAF1Q13077 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAF1Q13077 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAF1Q13077 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAF1Q13077 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAF1Q13077 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAF1Q13077 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
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